（１）蒸汽杀菌

采用蒸汽杀菌的时间一般为１５～３０ｍｉｎ，具体时间依设备、生产规模以及设备污染程度而定。所用的蒸汽应经过过滤，以除去从锅炉到灌装车间管道中的污物。因为杀菌用蒸汽必须要经过灌装机所有的管道和灌装头，因此在杀菌结束、关闭蒸汽前，应该检查所有蒸汽通道是否关闭，以防止在蒸汽冷却后灌装系统内形成负压，造成 “吸气”现象，将不洁净的空气倒吸进入灌装设备，造成消毒过的部位被重新污染。

（２）热水循环杀菌

过滤设备和灌装设备的热水循环杀菌是将洁净的热水通过过滤器、灌装机以及相应的所有泵和管线，热水温度通常控制在设备进口温度保持在８２℃以上，出口温度保持在７２℃以上，至少保持２０ｍｉｎ以上。